我国科研团队发布水稻完整参考基因组

更新时间:2024-04-18 17:54:49点击:48 科研管理新闻

水稻基因组组装重要突破:为水稻育种提供新工具和数据基础

中国农业科学院深圳农业基因组研究所等多个单位联合发布消息,成功完成了水稻参考基因组的全面组装,填补了过去基因组的缺口,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要的大数据基础。这一突破性成果在《分子植物》(Molecular Plant)上发表,引起了广泛关注。

自2005年水稻品种“日本晴”的基因组草图发布以来,水稻研究进入了基因组学时代。随后,该基因组在2013年经过改进成为水稻的标准参考基因组,然而由于当时的测序和组装技术限制,该基因组在复杂结构区域的组装上存在着约占全长3%的缺口,这些缺口阻碍了水稻育种的深入研究。

据中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员商连光介绍,为了解决这一问题,研究团队以水稻“日本晴”为对象,充分利用新一代测序技术,成功完成了对“日本晴”的参考基因组的全面组装。这次组装的基因组大小为385.7百万碱基对,每一条染色体的端粒到端粒均由一条完整连续的序列所组成,碱基的精确度超过99.9999%。新的组装还新增了12.5百万碱基对的基因组序列,主要解锁了水稻基因组中一些复杂结构区域的信息,包括核糖体DNA序列、着丝粒区域、复杂转座子序列和端粒区域等。此外,还修正了因缺口导致的多个基因结构错误,并新增了1324个蛋白编码基因的注释。这一研究为水稻育种研究奠定了重要的理论基础。

这一突破为水稻育种和基因组研究提供了新的支持。水稻作为全球重要的粮食作物,其基因组组装的完整性对于深入了解水稻的生长发育和抗逆能力等特性至关重要。通过解决基因组组装的难题,研究人员将能够更加准确地分析水稻基因,进而为育种提供更精准的方向和策略。

这项研究的成功对于水稻领域具有重要意义,也为其他作物的基因组研究提供了借鉴。科学家们的努力不仅将深化我们对水稻的认识,还将为全球粮食安全和农业可持续发展做出积极贡献。